Die Entwicklung der Fruchtkörper beginnt mit dem eiförmigen Hexenei welches meist in der Erde verborgen liegt. Ab einem gewissen Entwicklungsstand entspringt daraus der eigentliche bis 12cm hohe Fruchtkörper. Die Gemeine Hundsrute wächst bevorzugt im Laubwald, seltener sind Vorkommen im Nadelwald.