Mit dem Untergrund ist der Dickschalige Kartoffelhartbovist durch Myzelstränge verbunden. Der Pilz wird gelegentlich vom Schmarotzer-Röhrling (Pseudoboletus parasiticus) parasitiert, die beiden Arten bilden eine Doppel-Mykorrhiza aus. Der Kartoffelbovist wird durch diesen Vorgang stark geschädigt.